说明：因为科技部有保密要求，所以科大官网没列全。


合肥微尺度国家研究中心；（最少相当于3个全国重点实验室）

火zai科学全国重点实验室；（牵头）
  
认知智能全国重点实验室；（依托）
  
核探测与核电子学全国重点实验室；（依托）
  
深空探测全国重点实验室；（牵头和依托）
  
精准智能化学全国重点实验室；（牵头）
  
免疫应答与免疫治疗全国重点实验室（牵头）；

仿生界面材料科学全国重点实验室；（牵头，科大苏州校区）

高原医学与中亚高发病防诊治全国重点实验室，（牵头，合肥综合性国家科学中心大健康研究院牵头，而大健康研究院的牵头单位是中科大）

另一个军方全国重点实验室（牵头，属于电子信息学院）


另外，科大参与共建的全国重点实验室至少10个以上
--
修改:Y93SSYS711 FROM 223.104.42.*
FROM 223.104.42.*

科大牵头的最少有12个，更新了：高原医学与中亚高发病防诊治全国重点实验室
--
FROM 223.104.42.*