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lihuoming (李子树下好乘凉) 于 (Wed Apr 19 10:00:47 2006) 提到:
多谢了！
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hillhong (aiming 98%) 于 (Wed Apr 19 12:13:33 2006) 提到:
有吗？我不知道
分子结构跟pKa的关系现在应该没有理论可以计算吧，最多对同系物有经验公式
【 在 lihuoming (李子树下好乘凉) 的大作中提到: 】
: 多谢了！
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c2h2c2h2 (飞飞飞扬) 于 (Wed Apr 19 12:23:36 2006) 提到:
应该可以把
其实就是反应的平衡常数嘛
【 在 hillhong (aiming 98%) 的大作中提到: 】
: 有吗？我不知道
: 分子结构跟pKa的关系现在应该没有理论可以计算吧，最多对同系物有经验公式
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hillhong (aiming 98%) 于 (Wed Apr 19 12:41:42 2006) 提到:
那反应的平衡常数呢？
你的意思是说计算反应前后能量差，然后求平衡常数？
一般的计算能量就要经过校正，而且是气态中的结果。
再考虑到溶剂的效应，虽然gaussian有提供溶剂的参数，但肯定不太准
在水溶液中，离子的水合能，离子强度对活度的影响，这些目前来说理论还不是很好吧
【 在 c2h2c2h2 (飞飞飞扬) 的大作中提到: 】
: 应该可以把
: 其实就是反应的平衡常数嘛
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lihuoming (李子树下好乘凉) 于 (Wed Apr 19 17:11:22 2006) 提到:
如果我一直某取代苯化合物的pKa值，再在里面引入一个官能团，能够计算出通过官能团
的引入而导致pKa的变化量吗？现在标准的pKa值都是在DMSO或者H2O里面测定的，溶剂
效应应该可以不加考虑吧？
【 在 hillhong (aiming 98%) 的大作中提到: 】
: 有吗？我不知道
: 分子结构跟pKa的关系现在应该没有理论可以计算吧，最多对同系物有经验公式
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hillhong (aiming 98%) 于 (Wed Apr 19 19:13:03 2006) 提到:
估计有经验公式吧
【 在 lihuoming (李子树下好乘凉) 的大作中提到: 】
: 如果我一直某取代苯化合物的pKa值，再在里面引入一个官能团，能够计算出通过官能团
: 的引入而导致pKa的变化量吗？现在标准的pKa值都是在DMSO或者H2O里面测定的，溶剂
: 效应应该可以不加考虑吧？
: ...................
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lihuoming (李子树下好乘凉) 于 (Wed Apr 19 21:51:34 2006) 提到:
这方面一点都不懂。呵呵，我还以为有一种软件，能够输入分子式，就给出pKa呢。
【 在 ghb (......) 的大作中提到: 】
: 能做分子动力学模拟的软件
: charmm, amber, gromacs .
: 可以基于自由能变化, 这方面文献很多的,如计算蛋白质中某残基侧链的pKa
: ...................
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lihuoming (李子树下好乘凉) 于 (Wed Apr 19 21:52:39 2006) 提到:
什么经验公式啊？电脑用的还是人用的？我的意思是能不能简单到人都可以计算的？
【 在 hillhong (aiming 98%) 的大作中提到: 】
: 估计有经验公式吧
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femn (femn) 于 (Thu Apr 20 13:43:57 2006) 提到:
ACD的软件可以算
C2下可以买上这么一个模块算
【 在 lihuoming (李子树下好乘凉) 的大作中提到: 】
: 这方面一点都不懂。呵呵，我还以为有一种软件，能够输入分子式，就给出pKa呢。