pdb的原子坐标部分格式大概是这样的
1~6列名称(通常"ATOM "或"HETATM",前者属于蛋白质后者substrate和H2O)
7~11列原子编号serial no.
13~16原子名称atom name
18~20残基名称residue name
23~26残基编号residue sequence
31~38 x坐标; 39~46 y坐标; 47~54 z坐标
55~60 occupancy
61~66 temperature factor
73~76 segid ID
77~78 元素符号
79~80 原子电荷(一般都没有列出,到第78列截止)
中间有一些空白列做为分割
建议你把第77~78, 31~54列拷贝出来,加上gaussian的前面那些route section等等
然后存成*.gjf,就可以用gaussview打开甚至直接用gaussian运行了
(可以用ultraedit或者word的列操作)
【 在 lucklu (深呼吸,Just do it) 的大作中提到: 】
: 我要是会编的话就自己编了,唉,周围没有懂的人,刚开始学着用,慢慢学吧,不急,
: 反正明年才毕业。这一年的时间慢慢探索,应该够了吧?
: 有什么小窍门让我尽快入门吗?
: ...................
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修改:ghb FROM 160.36.168.*
FROM 160.36.168.*